事実婚（夫婦別姓）での出産

事実婚で出産される（された）方、別姓で通称使用されている方、いらっしゃいませんか？
　現在、妊娠９か月です。夫とは結婚式はしたのですが、私の仕事の関係で別姓で通したいのと、
夫の姓を名乗る場合、「夫の家に入る」ような感じがするのがいやで、現在は事実婚です。
（夫は長男なので、自分は姓は変えないと言っています）。
　職場や日常生活は、事実婚でも特に問題もなくきたのですが（職場からは結婚祝い金もいただけました）、
出産を前に、出生届けの問題や、戸籍では子どもが非嫡出子になってしまうことなどを考えると、
夫は籍を入れて通称使用ではだめなのかと言いはじめていて、最近は喧嘩ばかりしています。
（夫は現在海外に単身赴任中で、面と向っていないのでよけい言い合いになります）。
　子どもが産まれる前に籍を入れないと、そんなに不都合が起こるのでしょうか？
　胎児認知についても調べてみましたが、出生届けに夫の名前が入るだけで、気分だけのような
気もしますし・・
　事実婚や、別姓での通称使用について、意見をお聞かせください。